75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0651 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  100 
 
 
672 aa  1326    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  46.95 
 
 
663 aa  478  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  43.69 
 
 
656 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  44.84 
 
 
654 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  41.4 
 
 
653 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  42.79 
 
 
653 aa  419  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  36.71 
 
 
669 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  38.53 
 
 
678 aa  364  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  36.69 
 
 
676 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  36.56 
 
 
689 aa  362  1e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  35.52 
 
 
683 aa  347  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  35.17 
 
 
664 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  37.29 
 
 
678 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  36.53 
 
 
661 aa  342  1e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  35.29 
 
 
664 aa  339  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  35.29 
 
 
664 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  35.98 
 
 
666 aa  338  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  35.98 
 
 
664 aa  337  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  38.37 
 
 
679 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  34.65 
 
 
668 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  34.34 
 
 
684 aa  320  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  37.38 
 
 
650 aa  314  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  35.66 
 
 
684 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  37.34 
 
 
658 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  36.29 
 
 
667 aa  309  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  36.05 
 
 
667 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  35.6 
 
 
675 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  35.22 
 
 
669 aa  301  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  35.94 
 
 
626 aa  300  7e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  37.79 
 
 
636 aa  300  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  34.22 
 
 
640 aa  296  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  34.84 
 
 
667 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  34.67 
 
 
657 aa  290  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  36.4 
 
 
673 aa  276  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  33.91 
 
 
662 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  32.16 
 
 
688 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  32.66 
 
 
644 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  34.62 
 
 
656 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  33.9 
 
 
647 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  32.44 
 
 
683 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  36.97 
 
 
647 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  31.92 
 
 
690 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  31.78 
 
 
690 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  36.01 
 
 
688 aa  253  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  36.16 
 
 
673 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  32.07 
 
 
690 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  31.76 
 
 
706 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  28.78 
 
 
664 aa  221  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  32.48 
 
 
768 aa  181  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  27.55 
 
 
659 aa  174  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  26.74 
 
 
638 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  26.58 
 
 
638 aa  164  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  28.23 
 
 
596 aa  138  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  25.82 
 
 
539 aa  136  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.14 
 
 
550 aa  97.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  29.47 
 
 
575 aa  79  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  22.68 
 
 
622 aa  77.4  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  32.64 
 
 
577 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  30.45 
 
 
578 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  25.28 
 
 
583 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  25.28 
 
 
583 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  30.77 
 
 
576 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  36.17 
 
 
540 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  36.17 
 
 
540 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  33.55 
 
 
581 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  31.8 
 
 
611 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  31.34 
 
 
585 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  26.64 
 
 
722 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  24.43 
 
 
583 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  24.19 
 
 
754 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 
740 aa  54.3  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  31.78 
 
 
540 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  26.11 
 
 
583 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  28.04 
 
 
612 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  29.34 
 
 
605 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>