74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0706 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  100 
 
 
550 aa  1077    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  37.67 
 
 
575 aa  329  8e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  34.52 
 
 
539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  25.96 
 
 
626 aa  157  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  27.05 
 
 
663 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  27.67 
 
 
656 aa  131  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  27.76 
 
 
657 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  27.85 
 
 
654 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  27.35 
 
 
675 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  25.97 
 
 
666 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  26.38 
 
 
636 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  26.54 
 
 
647 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  25.81 
 
 
664 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  26.12 
 
 
656 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  24.92 
 
 
664 aa  120  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  24.8 
 
 
664 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  24.6 
 
 
664 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  24.12 
 
 
688 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  24.88 
 
 
706 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  25.19 
 
 
684 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  27.59 
 
 
653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  27.59 
 
 
653 aa  111  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  24.32 
 
 
664 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  23.38 
 
 
659 aa  109  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  23.97 
 
 
690 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  24.13 
 
 
690 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  23.97 
 
 
690 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  25.38 
 
 
667 aa  107  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  27.66 
 
 
596 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  23.64 
 
 
683 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  24.84 
 
 
661 aa  105  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  30.24 
 
 
683 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  23.26 
 
 
644 aa  92  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  22.64 
 
 
689 aa  91.3  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  22.64 
 
 
669 aa  90.9  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  24.14 
 
 
672 aa  88.2  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  24.31 
 
 
577 aa  87  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  29.26 
 
 
676 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  35.4 
 
 
679 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  24.66 
 
 
581 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  34.57 
 
 
678 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  33.95 
 
 
678 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  24.4 
 
 
576 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  26.23 
 
 
605 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  34.09 
 
 
667 aa  81.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  25.72 
 
 
578 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  26.62 
 
 
684 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  25.59 
 
 
611 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  35.62 
 
 
650 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  29.96 
 
 
640 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  33.73 
 
 
658 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  34.23 
 
 
667 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  31.28 
 
 
688 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  35.14 
 
 
673 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  34.46 
 
 
673 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  25.81 
 
 
585 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  23 
 
 
622 aa  73.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  24.9 
 
 
768 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  24.76 
 
 
540 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  24.77 
 
 
638 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  29.91 
 
 
647 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  24.19 
 
 
540 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  24.58 
 
 
638 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  31.94 
 
 
662 aa  67  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  34 
 
 
669 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  23.97 
 
 
540 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  27.78 
 
 
722 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  23.18 
 
 
612 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  23.58 
 
 
583 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  26.83 
 
 
668 aa  54.7  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  21.96 
 
 
583 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  23.56 
 
 
754 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  22.08 
 
 
583 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  20.79 
 
 
583 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>