75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3808 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  100 
 
 		 647 aa  1198    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  55.47 
 
 		 667 aa  623  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  54.94 
 
 		 650 aa  624  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  55.74 
 
 		 667 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  55.54 
 
 		 667 aa  579  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  56 
 
 		 658 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  52.4 
 
 		 662 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  50.7 
 
 		 676 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  49.24 
 
 		 683 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  48.96 
 
 		 684 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  49.09 
 
 		 679 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  48.66 
 
 		 684 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  45.52 
 
 		 678 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  44.95 
 
 		 678 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  43.55 
 
 		 668 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  44.65 
 
 		 640 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  40.67 
 
 		 664 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  43.07 
 
 		 669 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  40.52 
 
 		 664 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  41.95 
 
 		 661 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  40.52 
 
 		 664 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  45.55 
 
 		 673 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  39.18 
 
 		 656 aa  356  7.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  39.67 
 
 		 654 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  45.09 
 
 		 688 aa  346  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  45.08 
 
 		 673 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  39.94 
 
 		 663 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  38.81 
 
 		 653 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  38.67 
 
 		 653 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  34.76 
 
 		 664 aa  306  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  34.1 
 
 		 666 aa  303  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  34.85 
 
 		 689 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  34.55 
 
 		 669 aa  297  5e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  36.16 
 
 		 672 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  35.11 
 
 		 657 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  32.63 
 
 		 626 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  31.38 
 
 		 706 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  29.99 
 
 		 683 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  30.07 
 
 		 688 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  30.66 
 
 		 690 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  30.51 
 
 		 690 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  30.56 
 
 		 690 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  31.02 
 
 		 675 aa  217  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  32.96 
 
 		 636 aa  213  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  30.61 
 
 		 656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  29.15 
 
 		 644 aa  165  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  31.05 
 
 		 647 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  26.48 
 
 		 659 aa  144  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  30.86 
 
 		 768 aa  136  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  26.26 
 
 		 664 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  26.36 
 
 		 638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  26.36 
 
 		 638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  26.38 
 
 		 550 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  25.32 
 
 		 622 aa  77.4  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  26.52 
 
 		 583 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.41 
 
 		 583 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  28.63 
 
 		 605 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.91 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  33.57 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  29.15 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  34.29 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  29.94 
 
 		 722 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  34.29 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  25 
 
 		 583 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  33.33 
 
 		 578 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  24.77 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  24.2 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  31.39 
 
 		 611 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  32.54 
 
 		 596 aa  53.9  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  28.28 
 
 		 575 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  29.65 
 
 		 577 aa  51.2  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  25.87 
 
 		 576 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  33.16 
 
 		 540 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  31.72 
 
 		 612 aa  43.9  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>