72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2111 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  100 
 
 		 540 aa  970    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  74.07 
 
 		 540 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  98.52 
 
 		 540 aa  957    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  29.68 
 
 		 576 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  33.62 
 
 		 605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  28.12 
 
 		 577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  30.33 
 
 		 612 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  28.47 
 
 		 622 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  31.62 
 
 		 611 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  29.16 
 
 		 581 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  28.73 
 
 		 583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  30.2 
 
 		 583 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  28.9 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  27.95 
 
 		 583 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  30.84 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  29.46 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  24.72 
 
 		 668 aa  79.7  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.62 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  27 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  30.89 
 
 		 656 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  23.22 
 
 		 626 aa  77  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  34.04 
 
 		 667 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  25.88 
 
 		 647 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  32.5 
 
 		 667 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  29.31 
 
 		 664 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  29.31 
 
 		 664 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  26.49 
 
 		 678 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  32.77 
 
 		 658 aa  75.5  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  33.61 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  29.11 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  28.88 
 
 		 664 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  25.57 
 
 		 664 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  28.19 
 
 		 678 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  29.22 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  26.14 
 
 		 676 aa  70.5  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  33.94 
 
 		 656 aa  70.1  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  36.36 
 
 		 650 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  33.69 
 
 		 647 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  22.55 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  28.08 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  30.52 
 
 		 722 aa  67.4  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  33.62 
 
 		 669 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  33.8 
 
 		 654 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  27.6 
 
 		 689 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  27.6 
 
 		 669 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  34.74 
 
 		 653 aa  65.1  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  32.41 
 
 		 683 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  34.74 
 
 		 653 aa  65.1  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  28.76 
 
 		 666 aa  64.3  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 740 aa  63.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  28.76 
 
 		 664 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  30 
 
 		 679 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  32.34 
 
 		 673 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  26.32 
 
 		 754 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  34.72 
 
 		 675 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  27.78 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  29.41 
 
 		 672 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  30.82 
 
 		 683 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  33.49 
 
 		 688 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  26.29 
 
 		 644 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  27.13 
 
 		 688 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  31.13 
 
 		 690 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  31.13 
 
 		 690 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  31.13 
 
 		 690 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  27.9 
 
 		 659 aa  55.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  25.81 
 
 		 768 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  33.03 
 
 		 673 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  25.16 
 
 		 657 aa  53.9  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  33.92 
 
 		 663 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  25.93 
 
 		 706 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5795  OPT superfamily oligopeptide transporter  29.08 
 
 		 634 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105717 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  23.95 
 
 		 638 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>