76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02096 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  100 
 
 
656 aa  1266    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  84.64 
 
 
654 aa  1034    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  84.18 
 
 
653 aa  1033    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  84.18 
 
 
653 aa  1033    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  48.5 
 
 
663 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  43.77 
 
 
672 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  39.64 
 
 
669 aa  399  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  39.64 
 
 
689 aa  398  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  40.33 
 
 
668 aa  389  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  37.89 
 
 
666 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  37.89 
 
 
664 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  38.31 
 
 
683 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  39.85 
 
 
676 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  38.4 
 
 
678 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  38.67 
 
 
678 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  37.78 
 
 
684 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  39.03 
 
 
650 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  39.97 
 
 
661 aa  367  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  37.93 
 
 
684 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  35.65 
 
 
664 aa  351  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  35.94 
 
 
664 aa  352  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  35.94 
 
 
664 aa  351  2e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  41.33 
 
 
657 aa  347  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  37.41 
 
 
679 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  38.12 
 
 
669 aa  343  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  39.84 
 
 
675 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  37.19 
 
 
667 aa  342  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  37.12 
 
 
667 aa  341  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  39.23 
 
 
673 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  36.51 
 
 
640 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  39.56 
 
 
658 aa  337  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  39.38 
 
 
647 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  40.47 
 
 
636 aa  334  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  36.46 
 
 
667 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  36 
 
 
626 aa  323  6e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  36.5 
 
 
662 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  39.08 
 
 
688 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  38.81 
 
 
673 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  37.48 
 
 
656 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  34.94 
 
 
688 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  32.86 
 
 
683 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  36.83 
 
 
647 aa  264  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  32.1 
 
 
644 aa  259  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  33.62 
 
 
690 aa  257  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  34.69 
 
 
690 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  34.54 
 
 
690 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  34.95 
 
 
706 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  31.96 
 
 
659 aa  234  3e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  34.39 
 
 
768 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  30.33 
 
 
664 aa  196  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  29.39 
 
 
638 aa  185  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  28.9 
 
 
638 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  30.41 
 
 
596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  27.67 
 
 
550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  31.72 
 
 
575 aa  94  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  27.38 
 
 
583 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  34.07 
 
 
539 aa  84.3  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  27.21 
 
 
583 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.01 
 
 
622 aa  83.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  27.5 
 
 
611 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  28.32 
 
 
583 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  26.07 
 
 
583 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  35.07 
 
 
540 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  35.07 
 
 
540 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  31.38 
 
 
581 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  28.81 
 
 
577 aa  64.3  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  32.3 
 
 
578 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  24.92 
 
 
576 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0737792 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  28.48 
 
 
754 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
740 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  30.86 
 
 
585 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  30.26 
 
 
722 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  32.33 
 
 
540 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  29.87 
 
 
605 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  28.72 
 
 
612 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5795  OPT superfamily oligopeptide transporter  28.92 
 
 
634 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>