72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2435 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  100 
 
 
664 aa  1326    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  43.93 
 
 
659 aa  479  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  33.33 
 
 
636 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  35.5 
 
 
656 aa  326  7e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  31.9 
 
 
626 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  32.49 
 
 
644 aa  320  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  34.19 
 
 
647 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  30.52 
 
 
688 aa  273  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  30.41 
 
 
706 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  30.68 
 
 
690 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  31.68 
 
 
683 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  31.24 
 
 
690 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  30.85 
 
 
690 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  29.55 
 
 
657 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  29.05 
 
 
672 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  30.47 
 
 
663 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  29.17 
 
 
675 aa  208  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  30.58 
 
 
768 aa  201  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  30.03 
 
 
656 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  28.13 
 
 
664 aa  191  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  27.96 
 
 
683 aa  190  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  27.99 
 
 
664 aa  188  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  26.76 
 
 
669 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  27.84 
 
 
664 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  26.76 
 
 
689 aa  183  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  29.08 
 
 
654 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  30.06 
 
 
653 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  29.91 
 
 
653 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  29.07 
 
 
661 aa  179  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  28 
 
 
638 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  28.11 
 
 
664 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  27.8 
 
 
666 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  27.52 
 
 
638 aa  170  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  29.66 
 
 
676 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  27.62 
 
 
668 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  29.06 
 
 
678 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  26.62 
 
 
684 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  26.62 
 
 
684 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  28.63 
 
 
667 aa  155  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  26.49 
 
 
678 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  27.98 
 
 
669 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  26.1 
 
 
667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  26.54 
 
 
662 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  24.45 
 
 
640 aa  145  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  27.62 
 
 
679 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  26.58 
 
 
650 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  24.87 
 
 
596 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  27.65 
 
 
658 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  26.59 
 
 
667 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  28.82 
 
 
673 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.75 
 
 
550 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  29.45 
 
 
688 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  29.35 
 
 
673 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  22.73 
 
 
575 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  29.25 
 
 
647 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  30.17 
 
 
539 aa  68.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  22.01 
 
 
622 aa  67.4  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  26.58 
 
 
578 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.1 
 
 
583 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  22.02 
 
 
583 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  24.51 
 
 
581 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  23.91 
 
 
583 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  21.28 
 
 
577 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  23.95 
 
 
612 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  22.84 
 
 
583 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  30.99 
 
 
540 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  30.99 
 
 
540 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  23.05 
 
 
540 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  22.5 
 
 
576 aa  47.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  21.56 
 
 
722 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  25.87 
 
 
585 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  22.22 
 
 
605 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>