69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4241 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  100 
 
 
583 aa  1122    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  81.44 
 
 
583 aa  865    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  98.97 
 
 
583 aa  1112    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  93.17 
 
 
583 aa  969    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  28.96 
 
 
612 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.29 
 
 
622 aa  178  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  27.74 
 
 
605 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  27.67 
 
 
581 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  27.65 
 
 
578 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  27.81 
 
 
585 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  25.3 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  25.52 
 
 
577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  30.62 
 
 
540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  27.18 
 
 
611 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  26.42 
 
 
657 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  28.39 
 
 
663 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  29.39 
 
 
540 aa  93.6  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  29.46 
 
 
540 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  27.69 
 
 
656 aa  88.6  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  27.11 
 
 
722 aa  87.4  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  27.26 
 
 
658 aa  87.4  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  23.92 
 
 
664 aa  83.6  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  25.55 
 
 
740 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  26.32 
 
 
672 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  26.39 
 
 
654 aa  78.2  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  24.79 
 
 
636 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  25.44 
 
 
626 aa  75.9  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  24.24 
 
 
661 aa  70.5  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  24.54 
 
 
683 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  25.3 
 
 
688 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  29.91 
 
 
664 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  29.91 
 
 
664 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  23.91 
 
 
664 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  24.13 
 
 
640 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  23.53 
 
 
667 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  25 
 
 
650 aa  65.1  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  27.33 
 
 
690 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  26.92 
 
 
690 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  25.2 
 
 
653 aa  63.9  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  25.65 
 
 
575 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  25.2 
 
 
653 aa  63.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  23.99 
 
 
659 aa  63.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  27.13 
 
 
690 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  30.17 
 
 
647 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  26.19 
 
 
664 aa  61.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  28.57 
 
 
676 aa  60.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  25.79 
 
 
666 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  30.51 
 
 
754 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  24.4 
 
 
706 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  28.05 
 
 
684 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  31.67 
 
 
662 aa  58.9  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  29.24 
 
 
668 aa  58.2  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  26.1 
 
 
656 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  23.38 
 
 
596 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  23.58 
 
 
647 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  23.9 
 
 
678 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  27.53 
 
 
667 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  23 
 
 
550 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  24.49 
 
 
768 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  24.19 
 
 
669 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  27 
 
 
678 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  26.45 
 
 
679 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  26.8 
 
 
683 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  27.88 
 
 
675 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  27.14 
 
 
673 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  29.21 
 
 
673 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  29.31 
 
 
688 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  23.49 
 
 
644 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  21.11 
 
 
539 aa  44.3  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>