72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1222 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  100 
 
 
622 aa  1249    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  36.5 
 
 
612 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  38.49 
 
 
605 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  31.51 
 
 
578 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  32.42 
 
 
581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  30.68 
 
 
585 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  30.74 
 
 
577 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  29.78 
 
 
576 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  31.86 
 
 
611 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  26.7 
 
 
583 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.44 
 
 
583 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  27.48 
 
 
583 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  27.01 
 
 
583 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  23.66 
 
 
722 aa  140  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  26.85 
 
 
678 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  26.23 
 
 
678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  25.36 
 
 
667 aa  118  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  28.55 
 
 
540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  28.37 
 
 
540 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  26.73 
 
 
676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  27.07 
 
 
540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  26.13 
 
 
662 aa  110  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  24.81 
 
 
666 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  23.7 
 
 
664 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  25.72 
 
 
684 aa  108  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  23.87 
 
 
664 aa  107  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  23.87 
 
 
664 aa  107  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  25.72 
 
 
683 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  23.71 
 
 
664 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  25.44 
 
 
650 aa  105  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  27.26 
 
 
596 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  24.01 
 
 
661 aa  99.4  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  24.81 
 
 
684 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  25.32 
 
 
640 aa  97.1  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  26.48 
 
 
669 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  25.59 
 
 
668 aa  94.4  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  25.49 
 
 
657 aa  93.6  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  24.42 
 
 
658 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  23.26 
 
 
689 aa  87.4  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  23.26 
 
 
669 aa  87  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  26.02 
 
 
740 aa  86.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  24.24 
 
 
667 aa  84.7  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  31.66 
 
 
679 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  24.02 
 
 
768 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  28.18 
 
 
663 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  26.2 
 
 
656 aa  77  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  23.99 
 
 
667 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  24.79 
 
 
647 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  24.54 
 
 
672 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  22.42 
 
 
626 aa  76.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  23.93 
 
 
636 aa  75.5  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  23 
 
 
550 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  22.91 
 
 
644 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  21.83 
 
 
754 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  22.11 
 
 
690 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  22.11 
 
 
690 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  22.11 
 
 
690 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  23.39 
 
 
647 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  23.77 
 
 
659 aa  65.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  24.84 
 
 
653 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  23.58 
 
 
675 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  22.58 
 
 
664 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  24.69 
 
 
653 aa  65.1  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  21.86 
 
 
656 aa  64.7  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  26.46 
 
 
683 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  25.16 
 
 
654 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  22.83 
 
 
688 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  23.9 
 
 
706 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  25.7 
 
 
688 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  25.61 
 
 
673 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5795  OPT superfamily oligopeptide transporter  21.4 
 
 
634 aa  53.9  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105717 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03020  oligopeptide transporter, putative  26.79 
 
 
797 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>