76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2650 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  100 
 
 		 656 aa  1280    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  49.92 
 
 		 636 aa  581  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  46.31 
 
 		 644 aa  548  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  44.43 
 
 		 626 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  42.5 
 
 		 647 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  39.47 
 
 		 688 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  38.28 
 
 		 657 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  38.62 
 
 		 706 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  38.1 
 
 		 683 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  38.45 
 
 		 690 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  38.38 
 
 		 690 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  38.34 
 
 		 690 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  41.27 
 
 		 768 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  34.86 
 
 		 664 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  36.24 
 
 		 638 aa  320  7e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  36.75 
 
 		 638 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  37.48 
 
 		 656 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  32.92 
 
 		 659 aa  298  3e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  35.69 
 
 		 663 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  34.66 
 
 		 675 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  35.84 
 
 		 653 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  35.99 
 
 		 654 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  35.84 
 
 		 653 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  34.77 
 
 		 672 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  32.86 
 
 		 666 aa  257  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  32.86 
 
 		 664 aa  255  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  32.64 
 
 		 689 aa  246  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  32.48 
 
 		 669 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  31.59 
 
 		 661 aa  240  8e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  34.33 
 
 		 669 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  31.65 
 
 		 683 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  31.47 
 
 		 678 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  30.45 
 
 		 678 aa  220  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  30.14 
 
 		 664 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  30.19 
 
 		 676 aa  219  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  30.1 
 
 		 664 aa  219  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  32.92 
 
 		 668 aa  217  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  29.67 
 
 		 664 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  32.03 
 
 		 662 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  32.41 
 
 		 667 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  30.51 
 
 		 684 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  30.27 
 
 		 684 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  30.72 
 
 		 679 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  30.94 
 
 		 650 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  29.78 
 
 		 640 aa  193  9e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  30.62 
 
 		 647 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  33.12 
 
 		 658 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  32.7 
 
 		 673 aa  191  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  32.57 
 
 		 667 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  30.61 
 
 		 667 aa  177  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  31.55 
 
 		 688 aa  173  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  31.06 
 
 		 673 aa  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  26.87 
 
 		 596 aa  138  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  26.46 
 
 		 550 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.52 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  23.5 
 
 		 754 aa  80.5  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.47 
 
 		 611 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  31 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  29.23 
 
 		 540 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  27.42 
 
 		 612 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  28.92 
 
 		 540 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  21.47 
 
 		 622 aa  67.8  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  31.17 
 
 		 581 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  22.14 
 
 		 722 aa  65.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  25.55 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  30.14 
 
 		 578 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.1 
 
 		 583 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  24.79 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  25.79 
 
 		 583 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  22.66 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  24.92 
 
 		 605 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  32.48 
 
 		 585 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  26.3 
 
 		 540 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  25.79 
 
 		 583 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 		 740 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2688  Oligopeptide transporter OPT superfamily protein  25.68 
 
 		 547 aa  44.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000497009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>