66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4611 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  100 
 
 		 612 aa  1189    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  57.19 
 
 		 605 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  36.23 
 
 		 622 aa  343  7e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  33.39 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  32.22 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  32.76 
 
 		 581 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  32.83 
 
 		 585 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  32.24 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  35.1 
 
 		 611 aa  213  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  32.19 
 
 		 583 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  28.75 
 
 		 583 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  29.07 
 
 		 583 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  28.42 
 
 		 583 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  26.26 
 
 		 740 aa  147  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  23.94 
 
 		 722 aa  140  8.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  31.35 
 
 		 540 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  30.53 
 
 		 540 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  29.88 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  25.58 
 
 		 678 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  26.2 
 
 		 657 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  24.62 
 
 		 678 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  24.51 
 
 		 683 aa  90.5  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  23.58 
 
 		 666 aa  89  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  24.22 
 
 		 650 aa  88.2  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  23.58 
 
 		 664 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  25 
 
 		 684 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  26.5 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  22.69 
 
 		 668 aa  85.1  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  24.77 
 
 		 684 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  25.17 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  23.85 
 
 		 667 aa  80.1  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  25.64 
 
 		 647 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.89 
 
 		 550 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  30.88 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  22.17 
 
 		 539 aa  70.1  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  23.49 
 
 		 688 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  24.14 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  24.2 
 
 		 661 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  35.45 
 
 		 658 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  31.12 
 
 		 679 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  29.74 
 
 		 676 aa  61.6  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  23.26 
 
 		 664 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  23.26 
 
 		 664 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  23.68 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  23.61 
 
 		 664 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  29.65 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  32.65 
 
 		 669 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  27.5 
 
 		 662 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  27.38 
 
 		 688 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  26.39 
 
 		 640 aa  55.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  27.38 
 
 		 673 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  24.88 
 
 		 575 aa  54.3  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  27.59 
 
 		 673 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  27.22 
 
 		 675 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  29.84 
 
 		 667 aa  51.6  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  25.59 
 
 		 653 aa  50.8  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  25.59 
 
 		 653 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  30.04 
 
 		 667 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  30.69 
 
 		 654 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  27.18 
 
 		 672 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  31.72 
 
 		 647 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  29.11 
 
 		 669 aa  45.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  29.11 
 
 		 689 aa  45.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03020  oligopeptide transporter, putative  27.34 
 
 		 797 aa  44.3  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  22.42 
 
 		 683 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01880  hypothetical protein  26.14 
 
 		 751 aa  44.3  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>