20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01880 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF01880  hypothetical protein  100 
 
 
751 aa  1516    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314778  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73580  predicted protein  30.48 
 
 
782 aa  307  5.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0228681 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63766  predicted protein  29.81 
 
 
782 aa  298  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.269409  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03020  oligopeptide transporter, putative  29.22 
 
 
797 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07188  small oligopeptide transporter, OPT family (AFU_orthologue; AFUA_6G10220)  28.89 
 
 
753 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30203  predicted protein  27.41 
 
 
771 aa  271  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06360  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 
752 aa  270  5e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07597  oligopeptide transporter family (Eurofung)  28.1 
 
 
794 aa  269  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.793028  normal  0.323824 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33298  predicted protein  25.88 
 
 
765 aa  259  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00720  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 
961 aa  253  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00839319  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07702  oligopeptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03140)  24.45 
 
 
695 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50085  predicted protein  26.25 
 
 
911 aa  200  6e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.100109 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00560  conserved hypothetical protein  24.1 
 
 
812 aa  198  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57741  predicted protein  25.6 
 
 
907 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06452  OPT peptide transporter Mtd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00910)  25.03 
 
 
746 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86389  oligopeptide transporter protein  26.36 
 
 
917 aa  184  4.0000000000000006e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242986  normal  0.703425 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31037  predicted protein  24.74 
 
 
891 aa  175  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.629932  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63741  predicted protein  24.11 
 
 
913 aa  158  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.294425 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08374  OPT oligopeptide transporter family (Eurofung)  24.36 
 
 
756 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354659  normal  0.211315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  26.14 
 
 
612 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>