19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33298 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_30203  predicted protein  70.24 
 
 
771 aa  1072    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33298  predicted protein  100 
 
 
765 aa  1567    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06360  conserved hypothetical protein  41.54 
 
 
752 aa  559  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07702  oligopeptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03140)  45.02 
 
 
695 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00720  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 
961 aa  250  6e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00839319  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03020  oligopeptide transporter, putative  27.59 
 
 
797 aa  238  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01880  hypothetical protein  25.62 
 
 
751 aa  238  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314778  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07597  oligopeptide transporter family (Eurofung)  24.9 
 
 
794 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.793028  normal  0.323824 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63766  predicted protein  25.82 
 
 
782 aa  226  9e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.269409  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73580  predicted protein  26.39 
 
 
782 aa  226  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0228681 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50085  predicted protein  26.16 
 
 
911 aa  224  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.100109 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57741  predicted protein  25.87 
 
 
907 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00560  conserved hypothetical protein  24.43 
 
 
812 aa  208  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06452  OPT peptide transporter Mtd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00910)  23.79 
 
 
746 aa  203  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86389  oligopeptide transporter protein  25 
 
 
917 aa  197  6e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242986  normal  0.703425 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31037  predicted protein  24.72 
 
 
891 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.629932  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63741  predicted protein  24.52 
 
 
913 aa  182  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.294425 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07188  small oligopeptide transporter, OPT family (AFU_orthologue; AFUA_6G10220)  25.19 
 
 
753 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08374  OPT oligopeptide transporter family (Eurofung)  23.52 
 
 
756 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354659  normal  0.211315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>