19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00560 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00560  conserved hypothetical protein  100 
 
 
812 aa  1669    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50085  predicted protein  37.66 
 
 
911 aa  493  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.100109 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31037  predicted protein  38.5 
 
 
891 aa  487  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.629932  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00720  conserved hypothetical protein  36.35 
 
 
961 aa  464  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00839319  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63741  predicted protein  34.98 
 
 
913 aa  452  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.294425 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63766  predicted protein  34.64 
 
 
782 aa  443  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.269409  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57741  predicted protein  33.54 
 
 
907 aa  445  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03020  oligopeptide transporter, putative  33.66 
 
 
797 aa  440  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73580  predicted protein  34.08 
 
 
782 aa  437  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0228681 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86389  oligopeptide transporter protein  33.42 
 
 
917 aa  431  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242986  normal  0.703425 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07597  oligopeptide transporter family (Eurofung)  32.04 
 
 
794 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.793028  normal  0.323824 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07188  small oligopeptide transporter, OPT family (AFU_orthologue; AFUA_6G10220)  34.73 
 
 
753 aa  416  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08374  OPT oligopeptide transporter family (Eurofung)  31.31 
 
 
756 aa  270  8e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354659  normal  0.211315 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33298  predicted protein  24.43 
 
 
765 aa  208  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30203  predicted protein  23.83 
 
 
771 aa  178  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01880  hypothetical protein  24.1 
 
 
751 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314778  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06360  conserved hypothetical protein  22.82 
 
 
752 aa  157  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06452  OPT peptide transporter Mtd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00910)  21.14 
 
 
746 aa  134  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07702  oligopeptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03140)  22.93 
 
 
695 aa  95.5  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>