19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00720 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC00720  conserved hypothetical protein  100 
 
 
961 aa  1964    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00839319  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73580  predicted protein  42.84 
 
 
782 aa  602  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0228681 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63766  predicted protein  42.7 
 
 
782 aa  597  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.269409  normal  0.155514 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07188  small oligopeptide transporter, OPT family (AFU_orthologue; AFUA_6G10220)  43.27 
 
 
753 aa  560  1e-158  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03020  oligopeptide transporter, putative  38.39 
 
 
797 aa  542  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07597  oligopeptide transporter family (Eurofung)  38.99 
 
 
794 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.793028  normal  0.323824 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00560  conserved hypothetical protein  36.35 
 
 
812 aa  473  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50085  predicted protein  30.4 
 
 
911 aa  383  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.100109 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31037  predicted protein  31.4 
 
 
891 aa  372  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.629932  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57741  predicted protein  28.69 
 
 
907 aa  362  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86389  oligopeptide transporter protein  31.93 
 
 
917 aa  353  5.9999999999999994e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242986  normal  0.703425 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63741  predicted protein  30.98 
 
 
913 aa  341  2.9999999999999998e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.294425 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08374  OPT oligopeptide transporter family (Eurofung)  32.55 
 
 
756 aa  273  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354659  normal  0.211315 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33298  predicted protein  27.04 
 
 
765 aa  268  4e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30203  predicted protein  27.7 
 
 
771 aa  248  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01880  hypothetical protein  27.84 
 
 
751 aa  243  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314778  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06360  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 
752 aa  238  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06452  OPT peptide transporter Mtd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00910)  26.49 
 
 
746 aa  213  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07702  oligopeptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03140)  25.47 
 
 
695 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>