19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50085 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_86389  oligopeptide transporter protein  49.18 
 
 
917 aa  883    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242986  normal  0.703425 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63741  predicted protein  73.14 
 
 
913 aa  1351    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.294425 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50085  predicted protein  100 
 
 
911 aa  1853    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.100109 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57741  predicted protein  62.53 
 
 
907 aa  1172    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31037  predicted protein  75.36 
 
 
891 aa  1401    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.629932  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00560  conserved hypothetical protein  37.66 
 
 
812 aa  493  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63766  predicted protein  36.14 
 
 
782 aa  439  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.269409  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03020  oligopeptide transporter, putative  33.25 
 
 
797 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73580  predicted protein  34.75 
 
 
782 aa  424  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0228681 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07597  oligopeptide transporter family (Eurofung)  31.88 
 
 
794 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.793028  normal  0.323824 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07188  small oligopeptide transporter, OPT family (AFU_orthologue; AFUA_6G10220)  32.44 
 
 
753 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00720  conserved hypothetical protein  30.79 
 
 
961 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00839319  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08374  OPT oligopeptide transporter family (Eurofung)  34.72 
 
 
756 aa  329  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354659  normal  0.211315 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33298  predicted protein  26.16 
 
 
765 aa  224  8e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30203  predicted protein  25.7 
 
 
771 aa  192  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01880  hypothetical protein  26 
 
 
751 aa  180  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314778  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06360  conserved hypothetical protein  24.07 
 
 
752 aa  147  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06452  OPT peptide transporter Mtd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00910)  21.43 
 
 
746 aa  140  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07702  oligopeptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03140)  26.11 
 
 
695 aa  98.6  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>