20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63766 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07597  oligopeptide transporter family (Eurofung)  47.59 
 
 
794 aa  724    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.793028  normal  0.323824 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73580  predicted protein  93.86 
 
 
782 aa  1484    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0228681 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63766  predicted protein  100 
 
 
782 aa  1587    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.269409  normal  0.155514 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07188  small oligopeptide transporter, OPT family (AFU_orthologue; AFUA_6G10220)  42.65 
 
 
753 aa  613  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03020  oligopeptide transporter, putative  40.31 
 
 
797 aa  591  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00720  conserved hypothetical protein  42.7 
 
 
961 aa  591  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00839319  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00560  conserved hypothetical protein  34.64 
 
 
812 aa  450  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50085  predicted protein  36.14 
 
 
911 aa  448  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.100109 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31037  predicted protein  34.93 
 
 
891 aa  429  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.629932  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57741  predicted protein  35.88 
 
 
907 aa  428  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63741  predicted protein  34.81 
 
 
913 aa  401  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.294425 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86389  oligopeptide transporter protein  32.34 
 
 
917 aa  381  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242986  normal  0.703425 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08374  OPT oligopeptide transporter family (Eurofung)  33.04 
 
 
756 aa  284  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354659  normal  0.211315 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01880  hypothetical protein  29.95 
 
 
751 aa  283  9e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314778  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33298  predicted protein  25.82 
 
 
765 aa  236  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30203  predicted protein  26.76 
 
 
771 aa  228  3e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06452  OPT peptide transporter Mtd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00910)  25.85 
 
 
746 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06360  conserved hypothetical protein  25.44 
 
 
752 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07702  oligopeptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03140)  26.5 
 
 
695 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  23.73 
 
 
612 aa  50.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>