72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0197 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  100 
 
 		 683 aa  1344    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  64.19 
 
 		 690 aa  828    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  64.58 
 
 		 690 aa  829    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  64.72 
 
 		 690 aa  829    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  65.22 
 
 		 706 aa  845    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  66.42 
 
 		 688 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  44.43 
 
 		 636 aa  445  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  41.72 
 
 		 626 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  39.66 
 
 		 647 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  38.1 
 
 		 656 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  44.25 
 
 		 768 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  37.25 
 
 		 657 aa  352  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  36.01 
 
 		 644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  33.99 
 
 		 675 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  32.86 
 
 		 656 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  33.38 
 
 		 663 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  31.42 
 
 		 664 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  33.99 
 
 		 654 aa  257  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  32.44 
 
 		 672 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  31.71 
 
 		 653 aa  247  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  31.71 
 
 		 653 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  32.2 
 
 		 659 aa  238  4e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  30.48 
 
 		 638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  30.53 
 
 		 689 aa  234  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  30.53 
 
 		 669 aa  234  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  30.18 
 
 		 666 aa  234  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  31.2 
 
 		 638 aa  234  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  30.03 
 
 		 664 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  29.32 
 
 		 676 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  31.16 
 
 		 662 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  29.02 
 
 		 683 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  31.93 
 
 		 661 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  30.62 
 
 		 658 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  30.56 
 
 		 664 aa  212  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  30.56 
 
 		 664 aa  211  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  30.41 
 
 		 664 aa  211  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  30.24 
 
 		 667 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  32.42 
 
 		 667 aa  206  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  28.47 
 
 		 679 aa  206  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  30.87 
 
 		 668 aa  205  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  28.84 
 
 		 678 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  28.04 
 
 		 640 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  31 
 
 		 647 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  28.28 
 
 		 678 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  29.73 
 
 		 669 aa  196  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  29.13 
 
 		 684 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  28.24 
 
 		 684 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  28.98 
 
 		 650 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  29.01 
 
 		 667 aa  177  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  28.69 
 
 		 673 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  26.83 
 
 		 596 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  30.88 
 
 		 688 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  28.9 
 
 		 673 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  30.24 
 
 		 550 aa  99  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  30.09 
 
 		 575 aa  86.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  31.3 
 
 		 539 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  25.74 
 
 		 583 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  24.9 
 
 		 583 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  24.54 
 
 		 583 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.54 
 
 		 583 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  27.13 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  26.88 
 
 		 577 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  27.6 
 
 		 581 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  30.82 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  30.82 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  25.48 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  27.12 
 
 		 578 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  22.44 
 
 		 754 aa  54.3  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  26.45 
 
 		 740 aa  53.9  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  29.03 
 
 		 585 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  36.99 
 
 		 611 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  22.44 
 
 		 722 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>