58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1485 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  99.37 
 
 		 638 aa  1222    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  100 
 
 		 638 aa  1228    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  39.37 
 
 		 644 aa  342  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  36.24 
 
 		 656 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  34.55 
 
 		 636 aa  272  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  32.64 
 
 		 647 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  31.83 
 
 		 688 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  32.46 
 
 		 626 aa  241  4e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  29.67 
 
 		 706 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  30.48 
 
 		 683 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  28.62 
 
 		 659 aa  219  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  29.82 
 
 		 690 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  29.66 
 
 		 690 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  29.66 
 
 		 690 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  28.29 
 
 		 657 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  30.7 
 
 		 675 aa  204  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  29.82 
 
 		 768 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  29.1 
 
 		 656 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  28.84 
 
 		 654 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  27.4 
 
 		 653 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  27.4 
 
 		 653 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  26.92 
 
 		 664 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  27.75 
 
 		 663 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  27.91 
 
 		 664 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  27.91 
 
 		 664 aa  159  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  28.19 
 
 		 661 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  27.91 
 
 		 664 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  28.06 
 
 		 640 aa  154  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  26.58 
 
 		 672 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  26.25 
 
 		 683 aa  142  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  26.09 
 
 		 676 aa  140  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  26.88 
 
 		 684 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  26.55 
 
 		 678 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  24.26 
 
 		 664 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  26.98 
 
 		 662 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  24.26 
 
 		 666 aa  137  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  27.14 
 
 		 678 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  25.39 
 
 		 669 aa  136  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  25.39 
 
 		 689 aa  134  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  26.96 
 
 		 684 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  27.64 
 
 		 668 aa  130  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  25.45 
 
 		 667 aa  128  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  25.04 
 
 		 650 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  26.07 
 
 		 647 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  25.42 
 
 		 679 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  27.36 
 
 		 658 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  25.94 
 
 		 669 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  23.62 
 
 		 667 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  26.59 
 
 		 667 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  24.56 
 
 		 673 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.77 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  23.55 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  29.07 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  27.66 
 
 		 688 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  29.41 
 
 		 673 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  22.88 
 
 		 539 aa  67  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  26.14 
 
 		 581 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  25.76 
 
 		 578 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>