71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0353 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  100 
 
 		 576 aa  1139    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  81.05 
 
 		 577 aa  940    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  43.91 
 
 		 581 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  43.82 
 
 		 578 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  43.17 
 
 		 585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  33.39 
 
 		 612 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  31.62 
 
 		 605 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  29.78 
 
 		 622 aa  224  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  30.5 
 
 		 611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  25.4 
 
 		 583 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.05 
 
 		 583 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  25.68 
 
 		 583 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  26.09 
 
 		 583 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  29.06 
 
 		 540 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  28.88 
 
 		 540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  27 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  27.45 
 
 		 722 aa  95.9  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  23.84 
 
 		 754 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  25.07 
 
 		 740 aa  81.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.4 
 
 		 550 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  22.86 
 
 		 539 aa  77.8  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  24.04 
 
 		 675 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  23.12 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  25.12 
 
 		 667 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  23.31 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  24.24 
 
 		 657 aa  74.3  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  29.53 
 
 		 575 aa  73.9  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  24.27 
 
 		 664 aa  70.1  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  24.96 
 
 		 626 aa  70.1  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  27.13 
 
 		 683 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  24.39 
 
 		 647 aa  67  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  23.48 
 
 		 666 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  32.64 
 
 		 596 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  27.05 
 
 		 663 aa  64.3  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  27.84 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  27.84 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  30.61 
 
 		 768 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  24.79 
 
 		 656 aa  60.8  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  29.61 
 
 		 672 aa  60.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  23.87 
 
 		 658 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5795  OPT superfamily oligopeptide transporter  23.22 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  29.88 
 
 		 650 aa  58.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  25.82 
 
 		 668 aa  57  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  25.51 
 
 		 690 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  24.91 
 
 		 656 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  25.3 
 
 		 664 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  25.1 
 
 		 690 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  24.8 
 
 		 706 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  25.41 
 
 		 669 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  25.1 
 
 		 690 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  24.7 
 
 		 683 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  25.2 
 
 		 684 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  22.76 
 
 		 644 aa  51.6  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  27.04 
 
 		 667 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  30.69 
 
 		 640 aa  50.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  26.17 
 
 		 679 aa  50.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  26.64 
 
 		 678 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  25.2 
 
 		 684 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  25.5 
 
 		 676 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  26.71 
 
 		 662 aa  47.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  24.05 
 
 		 659 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  25.48 
 
 		 647 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  25.23 
 
 		 678 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  28.1 
 
 		 673 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  28.46 
 
 		 653 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  28.46 
 
 		 653 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5320  OPT superfamily oligopeptide transporter  26.27 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  28.1 
 
 		 688 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  25.11 
 
 		 664 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  25.56 
 
 		 664 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  28.28 
 
 		 673 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>