21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5795 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5320  OPT superfamily oligopeptide transporter  76.22 
 
 		 593 aa  806    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5795  OPT superfamily oligopeptide transporter  100 
 
 		 634 aa  1239    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  23.54 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  23.11 
 
 		 576 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  25.1 
 
 		 596 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  25.2 
 
 		 683 aa  55.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  28.11 
 
 		 611 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  28.1 
 
 		 668 aa  55.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  27.17 
 
 		 605 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  21.33 
 
 		 622 aa  52.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  26.76 
 
 		 666 aa  48.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  24.87 
 
 		 583 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  26.76 
 
 		 664 aa  47.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  28.7 
 
 		 657 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  28 
 
 		 664 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  30.39 
 
 		 754 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  27.56 
 
 		 664 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  23.84 
 
 		 640 aa  45.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  27.56 
 
 		 664 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  28.92 
 
 		 656 aa  45.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.95 
 
 		 540 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>