117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2240 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  100 
 
 
166 aa  326  7e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  89.04 
 
 
171 aa  229  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  72.37 
 
 
164 aa  177  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  67.57 
 
 
161 aa  174  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  69.09 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  48.61 
 
 
140 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  37.67 
 
 
143 aa  84.7  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  36.36 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  41.22 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  39.04 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  42 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  38.36 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  38.36 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  37.67 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  40.27 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  33.56 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  42.07 
 
 
141 aa  61.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  40.19 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  30.63 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  28.85 
 
 
187 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  35.62 
 
 
146 aa  57.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  40.28 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  40.2 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  34.58 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  28.57 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  38.24 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  28.83 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  34.46 
 
 
156 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  25.81 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  27.92 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0554  50S ribosomal protein L15P  43.84 
 
 
142 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.449351 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1706  ribosomal protein L15  40.56 
 
 
124 aa  51.6  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  34.25 
 
 
148 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  32.64 
 
 
155 aa  50.8  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  32.05 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  33.76 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  26.58 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  28.86 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  32 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  31.68 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  38.61 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  31.43 
 
 
210 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  31.97 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  34.62 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  31.33 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  31.33 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  38.89 
 
 
150 aa  48.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  29.22 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  25 
 
 
184 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  33.54 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  30.5 
 
 
146 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  30.72 
 
 
163 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  27.33 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  31.72 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  31.72 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  31.08 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  29.5 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  59.46 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  29.84 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  36.17 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  55.26 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  31.97 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  32.69 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  30.34 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  30.4 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  31.61 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  27.91 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  31.25 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  35.82 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  29.14 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  32.26 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  29.45 
 
 
144 aa  44.7  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  32.43 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  32.37 
 
 
177 aa  44.3  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  35.62 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  29.75 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  33.65 
 
 
243 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  30.41 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  32.39 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  26.97 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  34.62 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  38.54 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  30.19 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  30.16 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  38.16 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  40 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  57.58 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  29.93 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  29.22 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  34.23 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  35.21 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  29.92 
 
 
148 aa  42  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  29.87 
 
 
161 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  35.85 
 
 
149 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  35.85 
 
 
149 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  32.21 
 
 
146 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  29.87 
 
 
161 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  35.85 
 
 
149 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  27.45 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>