More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4302 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  100 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  77.92 
 
 
154 aa  235  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  79.47 
 
 
151 aa  234  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  80.28 
 
 
149 aa  228  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  74.83 
 
 
151 aa  225  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  77.78 
 
 
158 aa  217  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  74.5 
 
 
176 aa  213  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  75.18 
 
 
152 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  75 
 
 
243 aa  206  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  73.94 
 
 
146 aa  205  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  74.13 
 
 
163 aa  203  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  68.87 
 
 
177 aa  202  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  71.53 
 
 
150 aa  202  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  70.83 
 
 
146 aa  202  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  73.05 
 
 
164 aa  201  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  72.73 
 
 
152 aa  199  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  71.63 
 
 
164 aa  199  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  69.44 
 
 
146 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  69.72 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  65.52 
 
 
149 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  65.52 
 
 
149 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  65.52 
 
 
149 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  68.28 
 
 
147 aa  193  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 
147 aa  193  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  71.63 
 
 
210 aa  192  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  67.36 
 
 
152 aa  189  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  65.52 
 
 
148 aa  189  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 
147 aa  188  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  71.53 
 
 
164 aa  186  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  63.89 
 
 
146 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  71.53 
 
 
161 aa  184  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  65.25 
 
 
150 aa  184  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  64.83 
 
 
151 aa  183  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  66.21 
 
 
147 aa  180  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  66.9 
 
 
147 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  64.54 
 
 
151 aa  178  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  62.94 
 
 
148 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  60.56 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  57.53 
 
 
166 aa  142  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  52.35 
 
 
150 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  56.08 
 
 
146 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
153 aa  134  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  55.41 
 
 
146 aa  133  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
153 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  50.33 
 
 
153 aa  130  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  48.59 
 
 
174 aa  130  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  49.32 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  50.68 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  54.11 
 
 
149 aa  127  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  47.89 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  48.59 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
147 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  51.68 
 
 
147 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
152 aa  124  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 
146 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 
148 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 
146 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 
146 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 
144 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
146 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
146 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
146 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
146 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
146 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
146 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
146 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
147 aa  121  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 
146 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
146 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
147 aa  121  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  51.63 
 
 
163 aa  121  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
144 aa  121  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
153 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
146 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
146 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  49.66 
 
 
148 aa  120  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
154 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
159 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
159 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52.29 
 
 
153 aa  120  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  50.68 
 
 
148 aa  120  9e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  51.35 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  45.07 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  50 
 
 
146 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 
161 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 
152 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  50 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2215  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  46.94 
 
 
176 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 
147 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>