More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0234 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 146 aa  285  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  74.66 
 
 		 146 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  71.92 
 
 		 146 aa  202  8e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  70.55 
 
 		 146 aa  196  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  196  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  70.55 
 
 		 146 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  69.18 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  65.75 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  193  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  193  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  193  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  193  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  193  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  193  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  193  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  193  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  191  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  191  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  65.99 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  186  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  186  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  186  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  64.63 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  65.99 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  64.83 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 		 147 aa  176  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  173  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 147 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 147 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 147 aa  169  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 148 aa  166  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  60.81 
 
 		 148 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  58.9 
 
 		 172 aa  155  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  64.52 
 
 		 159 aa  150  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  57.64 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  58.11 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  52.11 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  56.76 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 149 aa  137  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  56.08 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  53.06 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 162 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  45.39 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  49.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  52.78 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  47.5 
 
 		 178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  51.35 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  51.63 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>