More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0866 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 157 aa  314  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  58.33 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  57.24 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  57.24 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 147 aa  153  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  60 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  56.64 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  56.64 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  56.55 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  56.55 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  56.55 
 
 		 146 aa  147  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  57.93 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  53.79 
 
 		 146 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  56.55 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  49.68 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 146 aa  141  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  58.5 
 
 		 172 aa  140  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 147 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  52.7 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  54.48 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 148 aa  134  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  55.94 
 
 		 144 aa  133  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0298  50S ribosomal protein L15P  50.33 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000286334  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  51.75 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  48.15 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  56.64 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0494  50S ribosomal protein L15P  51.72 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  47.2 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 145 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 145 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  47.22 
 
 		 148 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3424  50S ribosomal protein L15  52 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0339  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126422  hitchhiker  0.00264264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  50.7 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1041  50S ribosomal protein L15  54.4 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>