More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2888 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  100 
 
 
163 aa  320  6e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2600  50S ribosomal protein L15  76.16 
 
 
153 aa  229  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0101139  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  50.32 
 
 
152 aa  153  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  52.94 
 
 
147 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  52.94 
 
 
147 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  52.94 
 
 
147 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  51.61 
 
 
176 aa  137  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  52.29 
 
 
147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  50.98 
 
 
148 aa  130  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  53.38 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  49.02 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  50 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  51.63 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  52.98 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  49.4 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  50.98 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  51.63 
 
 
146 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  50.34 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1848  50S ribosomal protein L15  53.64 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  50.98 
 
 
146 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
146 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
146 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  54.73 
 
 
150 aa  124  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  51.63 
 
 
146 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  51.63 
 
 
146 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  45.39 
 
 
152 aa  124  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  49.03 
 
 
170 aa  123  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 
146 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 
147 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 
146 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 
176 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  51.63 
 
 
153 aa  121  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  52.26 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
147 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  53.29 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 
148 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  49.34 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  51.63 
 
 
146 aa  117  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
153 aa  117  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  46.95 
 
 
157 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
153 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 
153 aa  117  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  50 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  49.01 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  45.39 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  48 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  48 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  51.97 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  48.39 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  48.39 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  48.39 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  44.97 
 
 
148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  50 
 
 
149 aa  115  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  51.28 
 
 
147 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  47.68 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  45.39 
 
 
146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  50.98 
 
 
149 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  52.35 
 
 
146 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  50 
 
 
164 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  52.7 
 
 
152 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  51.28 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  50.68 
 
 
243 aa  113  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  49.37 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  51.33 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  51.97 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  45.62 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  46.1 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  48.43 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  44.79 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  48.45 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  46.39 
 
 
160 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  50.97 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  48.43 
 
 
161 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  48.43 
 
 
161 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 
147 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  53.02 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  48.37 
 
 
146 aa  110  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  47.06 
 
 
147 aa  110  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1359  ribosomal protein L15  53.25 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  50 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  50.97 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>