More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0611 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
157 aa  307  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  82.17 
 
 
156 aa  253  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  78.21 
 
 
157 aa  242  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  74.03 
 
 
161 aa  239  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  68.87 
 
 
160 aa  217  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  68.21 
 
 
161 aa  217  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  68.21 
 
 
161 aa  217  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  67.55 
 
 
162 aa  196  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  62.03 
 
 
158 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  61.39 
 
 
158 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  66.88 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  59.35 
 
 
156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  59.35 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  59.35 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  58.17 
 
 
161 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 
169 aa  175  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 
169 aa  175  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  58 
 
 
167 aa  174  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  56.77 
 
 
156 aa  173  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  56.49 
 
 
169 aa  173  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  57.42 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  61.33 
 
 
175 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  57.59 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  58.13 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  56.49 
 
 
162 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  58.06 
 
 
155 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  55.84 
 
 
162 aa  167  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  55.84 
 
 
162 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  56.69 
 
 
161 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  56.69 
 
 
171 aa  164  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  52.83 
 
 
160 aa  163  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  58 
 
 
173 aa  159  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  52.67 
 
 
154 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  52.8 
 
 
161 aa  152  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  52.23 
 
 
164 aa  150  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  52.29 
 
 
162 aa  149  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2314  50S ribosomal protein L15  57.32 
 
 
161 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.268211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3165  50S ribosomal protein L15  57.52 
 
 
161 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0320015  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1383  50S ribosomal protein L15  55.41 
 
 
161 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1564  50S ribosomal protein L15  55.41 
 
 
161 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3648  50S ribosomal protein L15  54.14 
 
 
161 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 
146 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
146 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  52.05 
 
 
176 aa  127  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  43.71 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  43.71 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 
146 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  44.37 
 
 
146 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  45.03 
 
 
146 aa  121  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  47.02 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  43.42 
 
 
152 aa  118  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  46.95 
 
 
163 aa  117  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 
147 aa  117  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  42.31 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  43.71 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  44.03 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 
148 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  43.71 
 
 
182 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  43.62 
 
 
146 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  43.62 
 
 
146 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 
144 aa  114  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 
147 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  45.11 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  42.38 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  42.38 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  44.97 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  46.75 
 
 
153 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  39.74 
 
 
148 aa  111  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  39.74 
 
 
154 aa  111  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1848  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  40.4 
 
 
146 aa  110  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 
146 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  40.54 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  42.38 
 
 
184 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  44.59 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5769  predicted protein  44.87 
 
 
190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  45.1 
 
 
153 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>