More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0098 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  81.88 
 
 		 148 aa  246  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  77.7 
 
 		 153 aa  235  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  82.55 
 
 		 149 aa  231  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  61.07 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  60.4 
 
 		 148 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  56.08 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  56.76 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  56.76 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  58.11 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  56.08 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  56.64 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  56.64 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 146 aa  136  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  56.95 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  53.02 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  50 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  48.65 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  54.73 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 146 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  51.56 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  50 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  50 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  45.7 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 243 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  46.85 
 
 		 210 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  49.65 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  46.85 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  50.34 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  48 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  46.85 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  46.41 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  46.15 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  46.85 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1400  ribosomal protein L15  41.22 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  39.75 
 
 		 178 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  44.83 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  44.3 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>