More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0581 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
151 aa  300  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  75.97 
 
 
154 aa  237  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  79.47 
 
 
153 aa  234  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  75.5 
 
 
151 aa  234  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  76.55 
 
 
149 aa  226  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  70.83 
 
 
176 aa  198  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  68.24 
 
 
152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  68.28 
 
 
146 aa  196  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  65.56 
 
 
150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  67.59 
 
 
162 aa  192  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  66.22 
 
 
158 aa  191  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  67.36 
 
 
177 aa  190  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
147 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  66.44 
 
 
163 aa  188  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
147 aa  188  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  66.67 
 
 
164 aa  188  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  64.14 
 
 
146 aa  186  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  65.97 
 
 
243 aa  184  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  63.51 
 
 
151 aa  184  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  61.33 
 
 
150 aa  183  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  64.34 
 
 
146 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  58.94 
 
 
149 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  58.94 
 
 
149 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  65.73 
 
 
152 aa  180  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  58.94 
 
 
149 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  64.58 
 
 
210 aa  180  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  64.58 
 
 
164 aa  180  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  65.77 
 
 
164 aa  176  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  63.89 
 
 
147 aa  174  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  64.43 
 
 
161 aa  173  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  61.64 
 
 
147 aa  172  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  60.96 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  57.93 
 
 
146 aa  170  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  59.31 
 
 
152 aa  168  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 
147 aa  168  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  57.93 
 
 
148 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  59.59 
 
 
147 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  53.02 
 
 
147 aa  140  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
153 aa  137  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 
147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  51.01 
 
 
147 aa  133  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  48.65 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 
146 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  51.68 
 
 
152 aa  131  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 
146 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
153 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
149 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  51.02 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  50.34 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  54.42 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 
146 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  50.69 
 
 
148 aa  128  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  56.55 
 
 
147 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 
146 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  48.99 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
146 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
146 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
146 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
146 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
146 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 
148 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
146 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
146 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
146 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  53.25 
 
 
153 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  52.78 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 
170 aa  123  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
146 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  49.66 
 
 
148 aa  122  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 
146 aa  123  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  52 
 
 
151 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 
146 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
154 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
147 aa  120  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
147 aa  120  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 
146 aa  120  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  51.72 
 
 
149 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  45.14 
 
 
148 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  48.3 
 
 
146 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  48.05 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 
146 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  50.69 
 
 
147 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  46.53 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  43.84 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  47.95 
 
 
149 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  46.98 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>