More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0601 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 176 aa  348  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  82.43 
 
 		 164 aa  241  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  73.58 
 
 		 164 aa  228  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  71.71 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  73.43 
 
 		 243 aa  213  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  74.5 
 
 		 153 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  74.13 
 
 		 146 aa  212  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  72.22 
 
 		 163 aa  210  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  71.83 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  71.13 
 
 		 152 aa  206  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  72.22 
 
 		 147 aa  206  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  70.83 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  72.92 
 
 		 147 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  72.73 
 
 		 146 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  70.14 
 
 		 162 aa  205  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  72.54 
 
 		 152 aa  205  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  71.13 
 
 		 146 aa  204  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 		 149 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  71.03 
 
 		 147 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  70.83 
 
 		 151 aa  198  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  68.75 
 
 		 151 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  69.44 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  66.43 
 
 		 149 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  66.43 
 
 		 149 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  66.43 
 
 		 149 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  67.36 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  68.53 
 
 		 152 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  68.09 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  70.63 
 
 		 147 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  65.73 
 
 		 146 aa  190  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  72.54 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  68.57 
 
 		 150 aa  187  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  65.03 
 
 		 148 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  64.58 
 
 		 151 aa  185  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  64.34 
 
 		 147 aa  184  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  63.19 
 
 		 150 aa  183  9e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  71.13 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  68.06 
 
 		 147 aa  171  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 153 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 163 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  51.75 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  54.55 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  51.72 
 
 		 149 aa  119  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  46.15 
 
 		 152 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  45.45 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  46.85 
 
 		 148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  50.66 
 
 		 153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  48 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  52.11 
 
 		 150 aa  112  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  49.66 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 149 aa  111  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  46.85 
 
 		 149 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1359  ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 148 aa  107  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  48.23 
 
 		 144 aa  107  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  43.54 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  40.14 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  43.45 
 
 		 154 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  40.97 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>