More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0861 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  100 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  54.9 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  47.4 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  53.9 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  52.98 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  52.29 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  53.25 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  54.97 
 
 		 170 aa  136  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  50.65 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  51.63 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  50.65 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  51.63 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  50.65 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  52.29 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  49.02 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  50.99 
 
 		 146 aa  134  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  51.63 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  48.68 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 184 aa  132  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 182 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  47.4 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  50.66 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  52.94 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  48.7 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  49.68 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 147 aa  130  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 187 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  51.95 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  49.02 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 176 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  50.98 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1400  ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  48.43 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  47.37 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  46.75 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  48.05 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  52.78 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  44.81 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  49.35 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  45.75 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 184 aa  124  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  50.33 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  49.01 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 169 aa  123  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 146 aa  123  9e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 169 aa  123  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  47.4 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  49.02 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>