More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0334 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 162 aa  315  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  95.06 
 
 		 162 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  78.11 
 
 		 169 aa  260  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  77.51 
 
 		 169 aa  258  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  77.51 
 
 		 169 aa  258  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  83.22 
 
 		 167 aa  249  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  76.51 
 
 		 160 aa  233  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  74.5 
 
 		 160 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  72.22 
 
 		 164 aa  215  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 159 aa  210  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  71.14 
 
 		 160 aa  207  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  68.92 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  65.38 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  65.1 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  63.46 
 
 		 161 aa  194  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  64.43 
 
 		 161 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  64.43 
 
 		 161 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 		 158 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  65.77 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  63.76 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  62.18 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  66.89 
 
 		 171 aa  189  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  62.18 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  62.18 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  67.57 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  63.06 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  62.03 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  59.01 
 
 		 161 aa  184  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  61.49 
 
 		 157 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  61.07 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  59.06 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  55.84 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3165  50S ribosomal protein L15  65.54 
 
 		 161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0320015  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2314  50S ribosomal protein L15  65.54 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.268211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3648  50S ribosomal protein L15  66.89 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1564  50S ribosomal protein L15  62.84 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  54.6 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1383  50S ribosomal protein L15  61.49 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  54.66 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  54.36 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 146 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 146 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  131  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5769  predicted protein  46.75 
 
 		 190 aa  130  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  54.36 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 148 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  53.69 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  53.69 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  48.15 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  53.02 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 146 aa  124  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0427  50S ribosomal protein L15  45.39 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.169028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  45.64 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28191  Putative mitochondrial ribosomal protein L15  45.78 
 
 		 257 aa  118  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0594  50S ribosomal protein L15  45.26 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0168848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 148 aa  117  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>