More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1334 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 173 aa  331  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  75.29 
 
 		 171 aa  251  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  72.83 
 
 		 175 aa  244  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  72.85 
 
 		 160 aa  217  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  65.62 
 
 		 159 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  68.87 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  69.74 
 
 		 155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  65.19 
 
 		 158 aa  197  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  64.56 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  66.67 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  62.13 
 
 		 169 aa  194  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  62.13 
 
 		 169 aa  194  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  65.19 
 
 		 160 aa  194  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  67.11 
 
 		 156 aa  193  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  67.11 
 
 		 156 aa  193  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  62.35 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  60.48 
 
 		 167 aa  191  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  65.79 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  61.54 
 
 		 169 aa  190  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  61.25 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  62.91 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  67.57 
 
 		 162 aa  187  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  66.89 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  61.35 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  61.69 
 
 		 154 aa  185  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  62 
 
 		 160 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  62 
 
 		 161 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  62 
 
 		 161 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  62.42 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  62 
 
 		 156 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  63.4 
 
 		 159 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3648  50S ribosomal protein L15  64.2 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  58.94 
 
 		 162 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  58.28 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  56.44 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2314  50S ribosomal protein L15  62.91 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.268211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3165  50S ribosomal protein L15  61.59 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0320015  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  57.32 
 
 		 157 aa  160  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  56.38 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  55.92 
 
 		 164 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  54.72 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  54.09 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  54.09 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1383  50S ribosomal protein L15  59.6 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1564  50S ribosomal protein L15  58.28 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  53.95 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  54.61 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  50.66 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 		 147 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  51.97 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  51.97 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  50.98 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  50 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_002978  WD0663  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 156 aa  132  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.158119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 146 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 146 aa  131  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 		 146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  48.05 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 146 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 147 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  47.4 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0445  50S ribosomal protein L15  51.63 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000479613  hitchhiker  0.000107522 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0594  50S ribosomal protein L15  48.18 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0168848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 146 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0427  50S ribosomal protein L15  46.1 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.169028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0298  50S ribosomal protein L15P  50.34 
 
 		 144 aa  124  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000286334  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 144 aa  124  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2150  ribosomal protein L15  54.67 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0266224  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0413  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0388  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  45.39 
 
 		 145 aa  123  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  49.02 
 
 		 147 aa  122  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3890  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 143 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000709059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  49.02 
 
 		 147 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  45.03 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 146 aa  121  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0786  ribosomal protein L15  50 
 
 		 143 aa  121  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00496718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>