More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0214 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
144 aa  287  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  75 
 
 
144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  70.55 
 
 
146 aa  212  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  70.55 
 
 
146 aa  212  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  71.92 
 
 
146 aa  210  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  72.6 
 
 
146 aa  208  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
146 aa  204  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
146 aa  204  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
146 aa  204  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
146 aa  204  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
146 aa  204  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
146 aa  204  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
146 aa  204  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  68.49 
 
 
146 aa  204  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
146 aa  204  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  70.55 
 
 
146 aa  202  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  68.49 
 
 
146 aa  202  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  67.81 
 
 
146 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  68.49 
 
 
146 aa  197  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  70.55 
 
 
146 aa  192  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 
147 aa  177  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 
146 aa  174  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  58.22 
 
 
146 aa  170  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  60 
 
 
154 aa  169  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  59.59 
 
 
146 aa  166  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  59.18 
 
 
147 aa  166  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 
146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 
147 aa  159  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 
147 aa  159  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
146 aa  158  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 
146 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 
146 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 
146 aa  155  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 
146 aa  155  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  154  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  56.85 
 
 
146 aa  154  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 
146 aa  153  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 
146 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 
147 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  55.1 
 
 
147 aa  150  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  56.46 
 
 
147 aa  150  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 
148 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  64.14 
 
 
147 aa  148  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  57.43 
 
 
159 aa  148  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 
153 aa  147  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
148 aa  147  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 
147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  53.79 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  56.55 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  51.7 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  54.36 
 
 
162 aa  143  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  54.42 
 
 
147 aa  140  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 
147 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  49.31 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  50 
 
 
153 aa  137  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
147 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 
144 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 
152 aa  134  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 
160 aa  133  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  50.34 
 
 
149 aa  131  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  50 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  49.32 
 
 
150 aa  130  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 
173 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  48 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 
160 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 
161 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  48.23 
 
 
145 aa  128  3e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 
161 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 
157 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  45.03 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  55.94 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  45.03 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 
175 aa  127  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  46.25 
 
 
178 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
161 aa  126  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  46 
 
 
161 aa  126  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  51.02 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  46.94 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  46 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  49.64 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  46 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  43.71 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
150 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  46 
 
 
156 aa  124  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
150 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  43.71 
 
 
160 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  50.68 
 
 
172 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 
169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>