More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5769 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_5769  predicted protein  100 
 
 
190 aa  388  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28191  Putative mitochondrial ribosomal protein L15  47.52 
 
 
257 aa  155  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  49.69 
 
 
167 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  48.08 
 
 
169 aa  134  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  48.08 
 
 
169 aa  134  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  46.75 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  48.08 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  47.4 
 
 
162 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  46.5 
 
 
156 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  46.5 
 
 
156 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  46.75 
 
 
159 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  48.7 
 
 
162 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
156 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  46.5 
 
 
156 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  50.64 
 
 
175 aa  121  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  44.81 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  44.72 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  44.81 
 
 
158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37563  ribosomal protein L15/L10-like protein  41.14 
 
 
285 aa  118  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.597831  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  47.4 
 
 
157 aa  118  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03170  conserved hypothetical protein  41.71 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6523  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  45.22 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  45.86 
 
 
155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  47.4 
 
 
171 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  42.95 
 
 
160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  46.1 
 
 
146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  47.1 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  43.59 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  43.59 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  44.72 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  42.95 
 
 
161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  43.95 
 
 
160 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  44.81 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  46.15 
 
 
156 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  48.7 
 
 
159 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  44.72 
 
 
164 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  44.87 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  44.81 
 
 
173 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  43.42 
 
 
147 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  43.42 
 
 
147 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  43.87 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  41.4 
 
 
147 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  42.58 
 
 
146 aa  104  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  42.48 
 
 
146 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 
154 aa  104  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  43.59 
 
 
145 aa  103  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  42.86 
 
 
146 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  40.26 
 
 
147 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  41.83 
 
 
146 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  42.21 
 
 
144 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  39.22 
 
 
148 aa  100  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  40.26 
 
 
144 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 
146 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  39.74 
 
 
148 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 
146 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  41.67 
 
 
144 aa  99  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  40.26 
 
 
152 aa  99  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  41.03 
 
 
148 aa  99  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2306  ribosomal protein L15  39.35 
 
 
144 aa  98.6  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000818267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  40.51 
 
 
144 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  36.54 
 
 
146 aa  98.2  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0412  50S ribosomal protein L15  40.51 
 
 
144 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000458392  hitchhiker  0.00000250457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3495  50S ribosomal protein L15  40.51 
 
 
144 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000708831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  42.21 
 
 
161 aa  98.2  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  36.54 
 
 
146 aa  98.2  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03152  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0101402  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4299  50S ribosomal protein L15  40.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000187384  unclonable  0.0000000000528735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0844463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0203  50S ribosomal protein L15  41.14 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3690  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153727  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03103  hypothetical protein  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00739395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0338  50S ribosomal protein L15  40.51 
 
 
144 aa  97.8  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000670307  unclonable  0.0000000454999 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  40.26 
 
 
147 aa  97.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3732  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 
144 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 
146 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  41.56 
 
 
143 aa  97.1  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  40.26 
 
 
147 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  37.82 
 
 
154 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  39.87 
 
 
144 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  43.23 
 
 
146 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>