More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37563 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_37563  ribosomal protein L15/L10-like protein  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.597831  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5769  predicted protein  41.14 
 
 		 190 aa  119  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  41.94 
 
 		 169 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  41.94 
 
 		 169 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  40.24 
 
 		 162 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  41.29 
 
 		 167 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  41.29 
 
 		 169 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  40.24 
 
 		 162 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  43.62 
 
 		 147 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  43.15 
 
 		 148 aa  106  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  44.08 
 
 		 160 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  42.95 
 
 		 147 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28191  Putative mitochondrial ribosomal protein L15  40.1 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  42.95 
 
 		 147 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  39.74 
 
 		 160 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  40.38 
 
 		 161 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  40.38 
 
 		 161 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 176 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 147 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03170  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 158 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  41.45 
 
 		 158 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 160 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  42.95 
 
 		 147 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  42 
 
 		 157 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  40.26 
 
 		 161 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  41.72 
 
 		 156 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  41.45 
 
 		 162 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 		 157 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  38.82 
 
 		 156 aa  96.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  40.4 
 
 		 159 aa  95.9  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  42.67 
 
 		 152 aa  95.5  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  42 
 
 		 152 aa  95.1  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  40.13 
 
 		 161 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  44.93 
 
 		 146 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  42.28 
 
 		 146 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  42.38 
 
 		 177 aa  93.6  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 		 146 aa  92.8  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  42.38 
 
 		 164 aa  92  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  37.75 
 
 		 156 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  37.75 
 
 		 156 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 146 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  39.74 
 
 		 146 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  38.41 
 
 		 155 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  42.28 
 
 		 146 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  37.09 
 
 		 156 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  38.82 
 
 		 160 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  39.6 
 
 		 148 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  40.4 
 
 		 162 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  41.06 
 
 		 175 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 144 aa  90.5  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  38.82 
 
 		 182 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  40.67 
 
 		 146 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  41.45 
 
 		 154 aa  89.7  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  41.61 
 
 		 146 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  40.14 
 
 		 144 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 143 aa  89.4  7e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  37.84 
 
 		 154 aa  89.4  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  42.67 
 
 		 146 aa  89  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  38.26 
 
 		 146 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  38.82 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  40.46 
 
 		 159 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  40.82 
 
 		 144 aa  87  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  39.47 
 
 		 210 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  40.46 
 
 		 161 aa  86.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  39.1 
 
 		 152 aa  86.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01095  50S ribosomal subunit protein L15 (AFU_orthologue; AFUA_1G11940)  39.61 
 
 		 352 aa  85.9  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0924488  normal  0.670058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  38.93 
 
 		 147 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  40.54 
 
 		 243 aa  86.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  40.14 
 
 		 146 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  41.33 
 
 		 176 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  38.26 
 
 		 144 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  36.94 
 
 		 185 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  39.13 
 
 		 148 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  38.93 
 
 		 147 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3803  50S ribosomal protein L15  40.27 
 
 		 144 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000421274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  40.27 
 
 		 144 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  39.33 
 
 		 144 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  42.28 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03152  50S ribosomal protein L15  38.93 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0101402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0424  50S ribosomal protein L15  40.27 
 
 		 144 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  38.93 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  39.19 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  38.93 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  38.93 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  38.93 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  38.93 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  38.93 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  38.85 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>