More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0309 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 146 aa  285  1e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  64.38 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 		 146 aa  190  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  189  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  189  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 		 144 aa  182  9e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 144 aa  179  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  58.74 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  57.82 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  56.16 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  58.62 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  58.67 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  67.59 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  55.48 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 172 aa  147  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  57.93 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  50.99 
 
 		 157 aa  143  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  143  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  143  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  51.32 
 
 		 160 aa  143  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  52.38 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  55.41 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 147 aa  141  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  54 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  54 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  50.33 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  46.25 
 
 		 178 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  52.32 
 
 		 175 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 158 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>