More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1268 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 171 aa  333  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  78.95 
 
 		 175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  78.71 
 
 		 173 aa  246  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  66.04 
 
 		 159 aa  204  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  66.25 
 
 		 160 aa  203  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  69.93 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  66.88 
 
 		 167 aa  200  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  62.89 
 
 		 160 aa  197  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  68.63 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  68.63 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  64.15 
 
 		 158 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  63.19 
 
 		 161 aa  194  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  66.45 
 
 		 155 aa  194  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  67.33 
 
 		 160 aa  193  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  63.52 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  68.92 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  62.75 
 
 		 154 aa  190  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  66.89 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  66.89 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  61.88 
 
 		 162 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  62 
 
 		 161 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  62.67 
 
 		 160 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  62 
 
 		 161 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  64.67 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  62.99 
 
 		 157 aa  180  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  60.74 
 
 		 164 aa  177  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  61.33 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  66.67 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  59.12 
 
 		 162 aa  170  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  59.73 
 
 		 161 aa  168  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3648  50S ribosomal protein L15  64.15 
 
 		 161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  56.69 
 
 		 157 aa  164  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  55.7 
 
 		 161 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3165  50S ribosomal protein L15  61.35 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0320015  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  55.97 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2314  50S ribosomal protein L15  60.74 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.268211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1383  50S ribosomal protein L15  59.75 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1564  50S ribosomal protein L15  59.75 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  54.55 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  53.9 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  53.9 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  52.8 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  52.98 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  52.32 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  48.34 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0663  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.158119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 147 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0594  50S ribosomal protein L15  46.72 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0168848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0427  50S ribosomal protein L15  45.39 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.169028  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  46.36 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  45.16 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 152 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 144 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0338  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000670307  unclonable  0.0000000454999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5769  predicted protein  47.4 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0342  ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 142 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000342315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 146 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>