More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3165 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3165  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 161 aa  313  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0320015  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  86.42 
 
 		 162 aa  280  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2314  50S ribosomal protein L15  96.89 
 
 		 161 aa  270  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.268211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  79.5 
 
 		 161 aa  261  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1564  50S ribosomal protein L15  84.47 
 
 		 161 aa  238  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1383  50S ribosomal protein L15  83.85 
 
 		 161 aa  237  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3648  50S ribosomal protein L15  83.85 
 
 		 161 aa  234  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  69.08 
 
 		 160 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  68.21 
 
 		 167 aa  214  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  71.62 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  71.62 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  65.41 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  65.58 
 
 		 160 aa  208  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  68.92 
 
 		 169 aa  203  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  65.79 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  65.33 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  60 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  65.54 
 
 		 162 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  63.33 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  63.33 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  66.23 
 
 		 164 aa  193  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  63.33 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  63.16 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  64.86 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  61.01 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  66 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  63.33 
 
 		 155 aa  191  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  61.84 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  61.35 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  61.59 
 
 		 173 aa  187  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  56.88 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  60 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  62.89 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  57.33 
 
 		 160 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  57.52 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  58.67 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  56 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  56 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  54.78 
 
 		 162 aa  163  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  53.33 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  55.28 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  51.63 
 
 		 146 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  51.32 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  51.63 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  52.9 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  50.64 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  50.64 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  49.02 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  49.36 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 146 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 146 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  44.08 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  44.08 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  44.74 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 144 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 		 147 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  43.42 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  40.13 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  43.31 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  45.75 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  43.79 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  45.45 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  42.38 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  43.42 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  45.06 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_002978  WD0663  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.158119  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0594  50S ribosomal protein L15  45.99 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0168848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  42 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0427  50S ribosomal protein L15  45.99 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.169028  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  42 
 
 		 146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>