More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1633 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 161 aa  315  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  62.89 
 
 		 161 aa  194  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  65.1 
 
 		 167 aa  191  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  65.81 
 
 		 169 aa  190  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  65.81 
 
 		 169 aa  190  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  58.49 
 
 		 160 aa  186  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  65.54 
 
 		 160 aa  186  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  64.19 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  61.69 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  63.33 
 
 		 157 aa  183  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  63.23 
 
 		 169 aa  183  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  62.26 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  62.84 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  60.78 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  57.23 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  58.17 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  63.29 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  60 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  59.28 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  57.72 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  59.73 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  56.67 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  58.17 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  56 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  56 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2314  50S ribosomal protein L15  62.26 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.268211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  57.72 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  59.06 
 
 		 156 aa  167  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  54.25 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  56.86 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  56.21 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  56.21 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3165  50S ribosomal protein L15  61.01 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0320015  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1383  50S ribosomal protein L15  58.49 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1564  50S ribosomal protein L15  59.12 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3648  50S ribosomal protein L15  64.43 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  55.63 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  53.02 
 
 		 154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  52.83 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  53.64 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  52 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  51.32 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  53.33 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  51.97 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  53.64 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  54 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  52.32 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 147 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 146 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 147 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 243 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  49.33 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 147 aa  124  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 146 aa  124  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 146 aa  124  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  54 
 
 		 146 aa  124  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  49.32 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  49.01 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  52 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  46.67 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  50 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 148 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  50.98 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  50 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  49.67 
 
 		 148 aa  121  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>