More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09810 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  100 
 
 		 149 aa  296  7e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  77.85 
 
 		 149 aa  206  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23280  LSU ribosomal protein L15P  76.51 
 
 		 149 aa  180  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.332048  hitchhiker  0.00000574627 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  55.41 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  56.46 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 146 aa  146  9e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  57.82 
 
 		 146 aa  143  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  56.08 
 
 		 147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 145 aa  143  9e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52.32 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  53.85 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 147 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2215  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  49.66 
 
 		 154 aa  129  9e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  52.38 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  52.74 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  52.32 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 243 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  52.41 
 
 		 210 aa  126  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  53.42 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  50.98 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  52.7 
 
 		 157 aa  124  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1848  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 		 170 aa  122  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 160 aa  121  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  49.33 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>