More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0950 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  100 
 
 		 146 aa  290  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  79.72 
 
 		 163 aa  231  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  79.58 
 
 		 146 aa  230  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  76.92 
 
 		 210 aa  226  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  79.43 
 
 		 243 aa  226  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  78.57 
 
 		 152 aa  224  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  77.86 
 
 		 158 aa  221  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  76.39 
 
 		 150 aa  220  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  74.83 
 
 		 147 aa  218  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  75.71 
 
 		 152 aa  215  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  73.47 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  79.29 
 
 		 164 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  73.43 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  72.86 
 
 		 162 aa  210  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  79.29 
 
 		 161 aa  208  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  72.41 
 
 		 154 aa  207  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  71.72 
 
 		 151 aa  207  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  72.73 
 
 		 176 aa  206  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  73.94 
 
 		 153 aa  205  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  205  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  71.72 
 
 		 149 aa  204  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  69.23 
 
 		 164 aa  200  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  69.93 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  70 
 
 		 164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  65.28 
 
 		 149 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  68.28 
 
 		 151 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  65.28 
 
 		 149 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  65.28 
 
 		 149 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  194  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  69.23 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  67.83 
 
 		 150 aa  189  8e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  69.23 
 
 		 147 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  63.19 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 152 aa  184  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  70.75 
 
 		 147 aa  182  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  62.5 
 
 		 147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  61.81 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 153 aa  139  9e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  50.98 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 146 aa  119  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  47.95 
 
 		 149 aa  116  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 170 aa  114  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  43.36 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  51.68 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  46.05 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  47.3 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  47.3 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1359  ribosomal protein L15  51.32 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  43.84 
 
 		 174 aa  110  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>