More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  100 
 
 
148 aa  292  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  76.03 
 
 
146 aa  217  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  69.18 
 
 
147 aa  199  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  70.07 
 
 
147 aa  199  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  70.55 
 
 
152 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  72.22 
 
 
148 aa  198  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  71.53 
 
 
147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  69.44 
 
 
164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  70.83 
 
 
149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  70.83 
 
 
149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  70.83 
 
 
149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  67.36 
 
 
176 aa  192  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
147 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  68.06 
 
 
177 aa  191  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 
147 aa  190  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 
152 aa  189  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  66.67 
 
 
210 aa  189  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  65.52 
 
 
152 aa  187  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  66.67 
 
 
158 aa  187  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  64.58 
 
 
151 aa  187  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  67.13 
 
 
164 aa  186  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 
146 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  67.13 
 
 
243 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  64.58 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 
146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  63.7 
 
 
150 aa  178  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  62.94 
 
 
153 aa  176  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  62.07 
 
 
162 aa  174  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  61.38 
 
 
149 aa  174  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  61.38 
 
 
151 aa  174  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  61.81 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  61.38 
 
 
154 aa  169  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  64.83 
 
 
164 aa  167  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  64.83 
 
 
161 aa  165  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  57.93 
 
 
151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  57.64 
 
 
151 aa  156  8e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  56.25 
 
 
150 aa  155  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  58.22 
 
 
147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  49.32 
 
 
152 aa  128  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  54.11 
 
 
166 aa  127  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 
147 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  49.33 
 
 
149 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 
161 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
174 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  50 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  48.63 
 
 
150 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  51.68 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  45.95 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  42.66 
 
 
145 aa  114  6e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  48 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  44.08 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  45.14 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  48.97 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  44.06 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  51.37 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  48.98 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  42.47 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  42.47 
 
 
153 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  46.41 
 
 
157 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  45.39 
 
 
167 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  44.52 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  42.07 
 
 
148 aa  107  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 
160 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  44.52 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  46 
 
 
159 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  45.7 
 
 
153 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 
174 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  41.1 
 
 
153 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 
146 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 
146 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  43.36 
 
 
148 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  45.75 
 
 
161 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  47.14 
 
 
150 aa  105  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 
147 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 
148 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 
147 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 
171 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  44.74 
 
 
160 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  47.65 
 
 
149 aa  104  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  41.78 
 
 
147 aa  103  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  43.71 
 
 
162 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  47.95 
 
 
146 aa  103  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>