More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0274 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  82.17 
 
 		 157 aa  253  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  77.56 
 
 		 157 aa  236  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  76 
 
 		 160 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  74.67 
 
 		 161 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  74.67 
 
 		 161 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  71.07 
 
 		 161 aa  221  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  68.67 
 
 		 162 aa  201  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  62.82 
 
 		 158 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  63.23 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  65.33 
 
 		 175 aa  186  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  59.51 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  62.18 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  62.42 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  62.42 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  59.51 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  62.42 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  63.09 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  63.33 
 
 		 167 aa  185  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  66.04 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  63.23 
 
 		 155 aa  180  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  61.07 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  60.62 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  58.06 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  60.4 
 
 		 162 aa  177  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  60.76 
 
 		 160 aa  177  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  62 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  61.33 
 
 		 171 aa  174  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  55.97 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  57.96 
 
 		 161 aa  166  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  54.25 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  54.55 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  57.72 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  56.49 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  56.95 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  54 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2314  50S ribosomal protein L15  60 
 
 		 161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.268211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3165  50S ribosomal protein L15  58.67 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0320015  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1383  50S ribosomal protein L15  58 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1564  50S ribosomal protein L15  58 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3648  50S ribosomal protein L15  54.14 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  46.67 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  43.23 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  41.29 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  46.2 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  42.95 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  44.03 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0427  50S ribosomal protein L15  42.96 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.169028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  44.79 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0663  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.158119  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  40.67 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  40.67 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  43.33 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 		 148 aa  111  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  43.92 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5769  predicted protein  46.15 
 
 		 190 aa  110  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0594  50S ribosomal protein L15  44.53 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0168848  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  44.37 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  42 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  42.67 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>