More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1776 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1776  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 
159 aa  305  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0923204  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  70.39 
 
 
157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  63.58 
 
 
160 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  62.25 
 
 
161 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  66.88 
 
 
157 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  66.04 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  62.25 
 
 
161 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  62.03 
 
 
162 aa  198  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  66.23 
 
 
160 aa  197  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  62.03 
 
 
162 aa  197  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  64.94 
 
 
169 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  64.94 
 
 
169 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  61.39 
 
 
161 aa  196  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  64.29 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  68.87 
 
 
162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  62.26 
 
 
158 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  62.89 
 
 
158 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  63.16 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  63.29 
 
 
161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  69.33 
 
 
175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 
171 aa  187  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  59.75 
 
 
159 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  64.67 
 
 
155 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  62.99 
 
 
156 aa  185  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  62.34 
 
 
156 aa  184  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  61.04 
 
 
156 aa  184  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  62.34 
 
 
156 aa  184  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  57.23 
 
 
160 aa  183  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  60.67 
 
 
167 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  63.4 
 
 
173 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  61.01 
 
 
161 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  61.69 
 
 
162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  62.03 
 
 
162 aa  175  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  58 
 
 
154 aa  174  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  58.6 
 
 
164 aa  167  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  57.86 
 
 
161 aa  157  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3165  50S ribosomal protein L15  62.89 
 
 
161 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0320015  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1564  50S ribosomal protein L15  62.26 
 
 
161 aa  154  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2314  50S ribosomal protein L15  62.89 
 
 
161 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.268211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1383  50S ribosomal protein L15  61.01 
 
 
161 aa  150  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3648  50S ribosomal protein L15  63.82 
 
 
161 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  48.34 
 
 
146 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 
147 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 
146 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  44.94 
 
 
154 aa  121  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  47.97 
 
 
147 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 
147 aa  120  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  44.59 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5769  predicted protein  48.7 
 
 
190 aa  119  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
147 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  44.97 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
147 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  44.37 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 
146 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 
148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  46.31 
 
 
149 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  48 
 
 
176 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 
146 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  43.62 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 
165 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  51.33 
 
 
144 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  43.71 
 
 
146 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 
164 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 
145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 
145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
144 aa  114  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 
182 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 
165 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 
165 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  45.03 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  42.38 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>