More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0777 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  80.95 
 
 		 146 aa  234  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 146 aa  194  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  64.63 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  65.31 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  64.63 
 
 		 146 aa  181  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  64.63 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  64.63 
 
 		 146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  62.59 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  63.27 
 
 		 146 aa  176  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  60.54 
 
 		 146 aa  173  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  61.22 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  61.22 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  61.22 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  60.14 
 
 		 147 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  63.51 
 
 		 147 aa  169  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  60.54 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  60.81 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  61.64 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  62.16 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  58.78 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 146 aa  153  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  58.78 
 
 		 146 aa  153  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 148 aa  151  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 144 aa  151  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 149 aa  151  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  56.46 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  59.21 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  55.41 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  55.41 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  55.86 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  52.7 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0445  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000479613  hitchhiker  0.000107522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  50.98 
 
 		 173 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 159 aa  131  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  53.79 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0473  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4730  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000304581  normal  0.615753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0645  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4529  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0663764  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0506  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0331231  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0503  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3803  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000421274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0342  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00281709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 148 aa  129  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00957  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  49.02 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3495  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000708831  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3690  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844463 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0412  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000458392  hitchhiker  0.00000250457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03103  hypothetical protein  53.79 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00739395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>