More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0678 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
145 aa  287  4e-77  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  73.1 
 
 
145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 
146 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  60.54 
 
 
146 aa  158  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 
146 aa  157  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 
146 aa  157  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 
146 aa  157  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 
146 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 
146 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 
146 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 
146 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 
146 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 
146 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 
146 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 
146 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 
146 aa  154  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 
146 aa  153  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 
147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  56.46 
 
 
146 aa  147  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  56.46 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 
147 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  54.11 
 
 
146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  55.41 
 
 
146 aa  143  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  53.06 
 
 
149 aa  143  9e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 
146 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 
146 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  47.26 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  51.02 
 
 
147 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
147 aa  135  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  48.63 
 
 
146 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 
145 aa  135  2e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 
146 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 
148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  52.38 
 
 
147 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  53.1 
 
 
148 aa  134  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0473  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
144 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4730  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
144 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000304581  normal  0.615753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0503  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
144 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448251  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 
144 aa  134  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0506  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
144 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0331231  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 
146 aa  134  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 
147 aa  133  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 
147 aa  133  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  50.35 
 
 
144 aa  133  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0645  ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4529  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0663764  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3740  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 
144 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000697996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 
146 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4151  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 
144 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000273601  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0215  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 
144 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000332243  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4037  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 
144 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000806157  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0219  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 
144 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000749249  hitchhiker  0.000103744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0250  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
144 aa  130  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0218  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
144 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000450664  unclonable  0.0000000000146358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0213  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
144 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00106088  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0218  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
144 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000246437  hitchhiker  0.00000000104256 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0738  ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  56.67 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4671  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0177  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150023  hitchhiker  0.000371203 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  49.65 
 
 
144 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06440  50S ribosomal protein L15  45.45 
 
 
144 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0232  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000110741  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  52.03 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4299  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 
144 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000187384  unclonable  0.0000000000528735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0203  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 
144 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  46.15 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  46.85 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  47.55 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0167  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3732  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3495  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000708831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03103  hypothetical protein  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00739395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0412  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000458392  hitchhiker  0.00000250457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3690  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153727  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4257  ribosomal protein L15  47.55 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000785215  unclonable  0.00000000000230267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>