More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1085 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 146 aa  295  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  74.66 
 
 		 146 aa  234  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  74.66 
 
 		 146 aa  234  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  73.97 
 
 		 148 aa  228  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  73.29 
 
 		 148 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 149 aa  208  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  65.99 
 
 		 147 aa  196  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  59.59 
 
 		 146 aa  179  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 146 aa  170  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 146 aa  169  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 146 aa  169  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  56.46 
 
 		 147 aa  166  8e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  57.93 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  54.11 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 146 aa  157  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 147 aa  153  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 144 aa  147  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 146 aa  146  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  52.78 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  51.97 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 148 aa  140  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 172 aa  140  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  48.97 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  44.76 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 184 aa  136  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  52.41 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3160  50S ribosomal protein L15  52.42 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0424  50S ribosomal protein L15P  48.97 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41995  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  50.68 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 153 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  45.52 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 187 aa  131  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  45.52 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>