More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3886 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  79.72 
 
 		 152 aa  236  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  79.58 
 
 		 146 aa  230  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  76.22 
 
 		 158 aa  229  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  76.6 
 
 		 243 aa  226  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  76.06 
 
 		 163 aa  224  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  73.94 
 
 		 152 aa  221  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  75.89 
 
 		 150 aa  220  6e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  75.86 
 
 		 147 aa  217  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  77.46 
 
 		 164 aa  214  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  71.13 
 
 		 210 aa  213  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  72.92 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  73.79 
 
 		 147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  72.54 
 
 		 162 aa  210  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  77.46 
 
 		 161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 		 146 aa  207  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  71.43 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  71.13 
 
 		 176 aa  204  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  70.42 
 
 		 164 aa  203  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  71.03 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  70.83 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  69.29 
 
 		 164 aa  202  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  72.73 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  68.31 
 
 		 149 aa  199  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  68.31 
 
 		 149 aa  199  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  68.31 
 
 		 149 aa  199  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  68.75 
 
 		 152 aa  197  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  65.31 
 
 		 151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  68.31 
 
 		 148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  68.28 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  69.01 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  65.49 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  64.79 
 
 		 151 aa  190  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  66.43 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  69.39 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  64.34 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  62.33 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  51.97 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  45.77 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 166 aa  123  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 152 aa  123  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  51.41 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  45.77 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  50.99 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 176 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  45.07 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  42.96 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  47.3 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1359  ribosomal protein L15  53.25 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  49.67 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  42.96 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  45.45 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  47.68 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  45.45 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  46.1 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  41.84 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  43.62 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 146 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 162 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 146 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  45.45 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  46.1 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  38.67 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  43.15 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>