More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0727 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 147 aa  286  5.0000000000000004e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  68.03 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  60.96 
 
 		 146 aa  173  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 		 146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  60.96 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  56.85 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  59.59 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  58.9 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  58.62 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  153  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  153  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  53.02 
 
 		 152 aa  151  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  63.01 
 
 		 172 aa  150  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  55.78 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3732  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  55.41 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03152  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0101402  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3690  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03103  hypothetical protein  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00739395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 176 aa  136  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 173 aa  135  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3495  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000708831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0412  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000458392  hitchhiker  0.00000250457 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0342  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00281709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 167 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0424  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107671  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 155 aa  133  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 		 158 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3803  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000421274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  53.1 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 182 aa  130  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  46.41 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  44.76 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 144 aa  130  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>