More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2404 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  82.26 
 
 		 187 aa  309  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  77.3 
 
 		 184 aa  294  6e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  75.14 
 
 		 184 aa  287  6e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  69.23 
 
 		 184 aa  258  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  65.56 
 
 		 182 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  68.86 
 
 		 184 aa  237  8e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  53.02 
 
 		 148 aa  131  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  50.33 
 
 		 146 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 147 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 148 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 147 aa  118  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 148 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 149 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  47.53 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  43.71 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 144 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  43.54 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 152 aa  111  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 146 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  44 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  43.05 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  44.9 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 144 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 161 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  46.62 
 
 		 147 aa  104  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  44.97 
 
 		 146 aa  104  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  42.47 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  40.99 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  43.92 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0378  50S ribosomal protein L15  47.76 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  43.71 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  43.84 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  39.47 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  42.24 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  42.76 
 
 		 149 aa  101  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  40.67 
 
 		 162 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  40.67 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  42.57 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 145 aa  100  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  41.72 
 
 		 152 aa  99.8  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  40.99 
 
 		 161 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  42.47 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  43.05 
 
 		 210 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>